MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Meiothermus ruber DSM 1279 genome

Total Repeats: 68571

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021081	GGC	2	6	45713	45718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881689
1002	NC_021081	GTG	2	6	45723	45728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881689
1003	NC_021081	CGA	2	6	45833	45838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1004	NC_021081	CGA	2	6	45857	45862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1005	NC_021081	GAG	2	6	45912	45917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881689
1006	NC_021081	CAC	2	6	45971	45976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881689
1007	NC_021081	GCC	2	6	45979	45984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881689
1008	NC_021081	GCC	2	6	45990	45995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881689
1009	NC_021081	TGC	2	6	45997	46002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1010	NC_021081	CTG	2	6	46014	46019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1011	NC_021081	CGA	2	6	46064	46069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1012	NC_021081	GAT	2	6	46109	46114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881689
1013	NC_021081	GCCC	2	8	46219	46226	0 %	0 %	25 %	75 %	482881689
1014	NC_021081	CAG	2	6	46302	46307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1015	NC_021081	CGC	2	6	46328	46333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881689
1016	NC_021081	G	7	7	46461	46467	0 %	0 %	100 %	0 %	482881689
1017	NC_021081	CGG	2	6	46613	46618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881689
1018	NC_021081	AGCG	2	8	46632	46639	25 %	0 %	50 %	25 %	482881689
1019	NC_021081	GGT	2	6	46667	46672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881689
1020	NC_021081	CCG	2	6	46702	46707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881689
1021	NC_021081	TGG	2	6	46771	46776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881689
1022	NC_021081	CAG	2	6	46815	46820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1023	NC_021081	GGT	2	6	46880	46885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881689
1024	NC_021081	TCA	2	6	46918	46923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881689
1025	NC_021081	ACC	2	6	46977	46982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881689
1026	NC_021081	AAG	2	6	47029	47034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482881689
1027	NC_021081	TGC	2	6	47086	47091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1028	NC_021081	GCT	2	6	47099	47104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1029	NC_021081	CGA	4	12	47111	47122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881689
1030	NC_021081	TCA	2	6	47155	47160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881689
1031	NC_021081	GGC	2	6	47379	47384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881690
1032	NC_021081	TGC	2	6	47525	47530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881690
1033	NC_021081	GGGCT	2	10	47539	47548	0 %	20 %	60 %	20 %	482881690
1034	NC_021081	TCA	2	6	47603	47608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881690
1035	NC_021081	GCG	2	6	47720	47725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881690
1036	NC_021081	TTC	2	6	47794	47799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482881690
1037	NC_021081	CGA	2	6	47838	47843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881690
1038	NC_021081	GCC	2	6	47920	47925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881690
1039	NC_021081	TGG	2	6	47939	47944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881690
1040	NC_021081	CGG	2	6	48002	48007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881690
1041	NC_021081	TGGAC	2	10	48018	48027	20 %	20 %	40 %	20 %	482881690
1042	NC_021081	GGT	2	6	48042	48047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881690
1043	NC_021081	GGA	2	6	48049	48054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881690
1044	NC_021081	ATC	2	6	48058	48063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881690
1045	NC_021081	TGG	2	6	48122	48127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881690
1046	NC_021081	G	6	6	48126	48131	0 %	0 %	100 %	0 %	482881690
1047	NC_021081	TGC	2	6	48161	48166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881690
1048	NC_021081	GAG	2	6	48208	48213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881690
1049	NC_021081	AGGG	2	8	48255	48262	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021081	CCT	2	6	48305	48310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482881691
1051	NC_021081	ACC	2	6	48322	48327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881691
1052	NC_021081	GGT	2	6	48357	48362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881691
1053	NC_021081	GCT	2	6	48363	48368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881691
1054	NC_021081	TGG	2	6	48371	48376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881691
1055	NC_021081	CAC	2	6	48471	48476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881691
1056	NC_021081	GGC	2	6	48507	48512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881691
1057	NC_021081	TGGGGG	2	12	48518	48529	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	482881691
1058	NC_021081	G	6	6	48585	48590	0 %	0 %	100 %	0 %	482881691
1059	NC_021081	CGG	2	6	48596	48601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881691
1060	NC_021081	CAT	2	6	48603	48608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881691
1061	NC_021081	GTG	2	6	48697	48702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881691
1062	NC_021081	GGC	2	6	48729	48734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881691
1063	NC_021081	ACT	2	6	48791	48796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881691
1064	NC_021081	TGATGG	2	12	48830	48841	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	482881691
1065	NC_021081	CG	3	6	48904	48909	0 %	0 %	50 %	50 %	482881691
1066	NC_021081	GCGG	2	8	49011	49018	0 %	0 %	75 %	25 %	482881691
1067	NC_021081	TGG	3	9	49019	49027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881691
1068	NC_021081	GGC	2	6	49078	49083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881691
1069	NC_021081	GGT	2	6	49092	49097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881691
1070	NC_021081	TGG	2	6	49294	49299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881691
1071	NC_021081	AGG	2	6	49400	49405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021081	AGCG	2	8	49414	49421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_021081	GGCT	2	8	49450	49457	0 %	25 %	50 %	25 %	482881692
1074	NC_021081	CTG	2	6	49482	49487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881692
1075	NC_021081	GGA	2	6	49547	49552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881692
1076	NC_021081	CGA	2	6	49616	49621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881692
1077	NC_021081	TGC	2	6	49714	49719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881692
1078	NC_021081	TCA	2	6	49732	49737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881692
1079	NC_021081	CCA	2	6	49753	49758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881692
1080	NC_021081	ACCC	2	8	49789	49796	25 %	0 %	0 %	75 %	482881692
1081	NC_021081	AAC	2	6	49797	49802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881692
1082	NC_021081	AGC	2	6	49824	49829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881692
1083	NC_021081	GGT	2	6	49841	49846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881692
1084	NC_021081	CAC	2	6	49871	49876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881692
1085	NC_021081	GGGC	2	8	49920	49927	0 %	0 %	75 %	25 %	482881692
1086	NC_021081	GGT	2	6	49928	49933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881692
1087	NC_021081	GCT	2	6	49950	49955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881692
1088	NC_021081	ACA	2	6	50011	50016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881692
1089	NC_021081	GCT	2	6	50021	50026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881692
1090	NC_021081	ATC	2	6	50058	50063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881692
1091	NC_021081	GCCGG	2	10	50076	50085	0 %	0 %	60 %	40 %	482881692
1092	NC_021081	CAG	2	6	50216	50221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881692
1093	NC_021081	CTA	2	6	50222	50227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881692
1094	NC_021081	AAC	2	6	50266	50271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881692
1095	NC_021081	CCA	2	6	50311	50316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881692
1096	NC_021081	CCG	2	6	50323	50328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881692
1097	NC_021081	GGC	3	9	50336	50344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881692
1098	NC_021081	GCCGG	2	10	50365	50374	0 %	0 %	60 %	40 %	482881692
1099	NC_021081	CCA	2	6	50470	50475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881692
1100	NC_021081	CTTCA	2	10	50579	50588	20 %	40 %	0 %	40 %	482881692
1101	NC_021081	AGG	2	6	50619	50624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021081	CTG	2	6	50717	50722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881693
1103	NC_021081	CAA	2	6	50728	50733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881693
1104	NC_021081	GGT	2	6	50740	50745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881693
1105	NC_021081	CAT	2	6	50755	50760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881693
1106	NC_021081	TGC	2	6	50766	50771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881693
1107	NC_021081	ACC	3	9	50840	50848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	482881693
1108	NC_021081	GGT	2	6	50890	50895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881693
1109	NC_021081	CAA	2	6	50932	50937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482881693
1110	NC_021081	GCC	2	6	50938	50943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482881693
1111	NC_021081	GCG	2	6	50986	50991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881693
1112	NC_021081	GAG	2	6	51014	51019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	482881693
1113	NC_021081	GGGT	2	8	51027	51034	0 %	25 %	75 %	0 %	482881693
1114	NC_021081	CGG	2	6	51044	51049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881693
1115	NC_021081	AG	3	6	51065	51070	50 %	0 %	50 %	0 %	482881693
1116	NC_021081	ACT	2	6	51090	51095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482881693
1117	NC_021081	CTGG	2	8	51125	51132	0 %	25 %	50 %	25 %	482881693
1118	NC_021081	G	8	8	51142	51149	0 %	0 %	100 %	0 %	482881693
1119	NC_021081	AGC	2	6	51150	51155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	482881693
1120	NC_021081	GGGC	2	8	51170	51177	0 %	0 %	75 %	25 %	482881693
1121	NC_021081	CTG	2	6	51179	51184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881693
1122	NC_021081	TGC	2	6	51201	51206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881693
1123	NC_021081	C	6	6	51231	51236	0 %	0 %	0 %	100 %	482881693
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1125	NC_021081	TGG	3	9	51300	51308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	482881693
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1494	NC_021081	AAG	2	6	66876	66881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1495	NC_021081	TA	3	6	66905	66910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1496	NC_021081	GGC	2	6	67051	67056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	482881708
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1498	NC_021081	ATG	2	6	67086	67091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482881708
1499	NC_021081	GCTT	2	8	67120	67127	0 %	50 %	25 %	25 %	482881708
1500	NC_021081	CTG	2	6	67161	67166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482881708

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